リードに同一メールアドレスのレコードが複数含まれています。その場合１通だけメールを送ることは可能ですか。

はい、可能です。autobahn for AppExchangeの重複除外配信機能（オプション）を使うことで、配信対象のリストに同じメールアドレスが複数存在する場合、メンテナンスをせずとも1通だけ配信できます。